Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms