Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCUBE3Q8IX30 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms