Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8AQ8IWT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms