Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms