Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms