Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A9Q8IVB4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms