Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC84Q86UT8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC84Q86UT8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms