Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00596Q86U02 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00596Q86U02 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms