Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms