Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP6Q7Z6E9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP6Q7Z6E9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms