Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCF23Q7RTU1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCF23Q7RTU1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms