Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNL6

FGD5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD5Q6ZNL6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FGD5Q6ZNL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD5Q6ZNL6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD5Q6ZNL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms