Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCD1Q6ZMY3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms