Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms