Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF40BQ6NWY9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms