Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms