Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALRD1Q5VYJ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MALRD1Q5VYJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms