Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUSD4Q5VX71 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms