Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRNL1Q5VV63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRNL1Q5VV63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms