Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD5Q5TGI4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms