Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC183Q5T5S1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms