Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms