Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CEP170Q5SW79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CEP170Q5SW79 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CEP170Q5SW79 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms