Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPANXN3Q5MJ09 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPANXN3Q5MJ09 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms