Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ESCO2Q56NI9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms