Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms