Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC44A4Q53GD3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms