Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN20Q4JDL3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms