Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TYSND1Q2T9J0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYSND1Q2T9J0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms