Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM1Q2NKQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGSM1Q2NKQ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms