Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTC1Q2NKJ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms