Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDO1Q16878 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDO1Q16878 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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