Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFA9Q16795 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFA9Q16795 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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