Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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