Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKIV2LQ15477 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.7 ms