Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP1Q15431 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP1Q15431 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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