Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PUM3Q15397 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUM3Q15397 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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