Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF3Q14653 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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IRF3Q14653 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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IRF3Q14653 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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IRF3Q14653 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF3Q14653 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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