Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM25Q14258 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM25Q14258 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms