Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBI3Q14213 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBI3Q14213 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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