Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARB2Q14108 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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