Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGB1Q14028 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
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