Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PDE6HQ13956 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PDE6HQ13956 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PDE6HQ13956 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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