Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEUROD1Q13562 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
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