Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TOP3AQ13472 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TOP3AQ13472 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TOP3AQ13472 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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TOP3AQ13472 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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