Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP140Q13342 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP140Q13342 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP140Q13342 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP140Q13342 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP140Q13342 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP140Q13342 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP140Q13342 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP140Q13342 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP140Q13342 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP140Q13342 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP140Q13342 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SP140Q13342 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SP140Q13342 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SP140Q13342 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP140Q13342 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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