Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms