Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHIT1Q13231 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CHIT1Q13231 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHIT1Q13231 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms