Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPS1Q13098 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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