Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRDM2Q13029 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
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